Protein–RNA interactions for Protein: A8MXY4

ZNF99, Zinc finger protein 99, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF99A8MXY4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF99A8MXY4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF99A8MXY4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF99A8MXY4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF99A8MXY4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF99A8MXY4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF99A8MXY4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF99A8MXY4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF99A8MXY4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF99A8MXY4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF99A8MXY4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF99A8MXY4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF99A8MXY4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF99A8MXY4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF99A8MXY4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF99A8MXY4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF99A8MXY4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF99A8MXY4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF99A8MXY4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF99A8MXY4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF99A8MXY4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF99A8MXY4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF99A8MXY4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF99A8MXY4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF99A8MXY4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF99A8MXY4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF99A8MXY4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF99A8MXY4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF99A8MXY4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF99A8MXY4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF99A8MXY4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF99A8MXY4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF99A8MXY4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF99A8MXY4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF99A8MXY4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF99A8MXY4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF99A8MXY4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF99A8MXY4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF99A8MXY4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF99A8MXY4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF99A8MXY4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF99A8MXY4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF99A8MXY4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF99A8MXY4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF99A8MXY4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF99A8MXY4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF99A8MXY4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF99A8MXY4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF99A8MXY4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF99A8MXY4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF99A8MXY4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF99A8MXY4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF99A8MXY4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF99A8MXY4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF99A8MXY4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms