Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM200CA6NKL6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM200CA6NKL6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM200CA6NKL6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM200CA6NKL6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM200CA6NKL6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM200CA6NKL6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM200CA6NKL6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM200CA6NKL6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM200CA6NKL6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM200CA6NKL6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM200CA6NKL6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM200CA6NKL6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM200CA6NKL6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM200CA6NKL6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM200CA6NKL6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM200CA6NKL6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM200CA6NKL6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM200CA6NKL6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM200CA6NKL6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM200CA6NKL6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM200CA6NKL6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM200CA6NKL6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM200CA6NKL6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM200CA6NKL6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM200CA6NKL6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM200CA6NKL6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM200CA6NKL6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM200CA6NKL6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM200CA6NKL6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM200CA6NKL6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM200CA6NKL6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM200CA6NKL6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM200CA6NKL6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM200CA6NKL6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM200CA6NKL6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM200CA6NKL6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM200CA6NKL6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM200CA6NKL6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM200CA6NKL6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM200CA6NKL6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM200CA6NKL6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM200CA6NKL6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms