Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TCAF2A6NFQ2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCAF2A6NFQ2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCAF2A6NFQ2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCAF2A6NFQ2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCAF2A6NFQ2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCAF2A6NFQ2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TCAF2A6NFQ2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCAF2A6NFQ2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCAF2A6NFQ2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCAF2A6NFQ2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCAF2A6NFQ2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TCAF2A6NFQ2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCAF2A6NFQ2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCAF2A6NFQ2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TCAF2A6NFQ2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TCAF2A6NFQ2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TCAF2A6NFQ2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TCAF2A6NFQ2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCAF2A6NFQ2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCAF2A6NFQ2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCAF2A6NFQ2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCAF2A6NFQ2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCAF2A6NFQ2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCAF2A6NFQ2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCAF2A6NFQ2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCAF2A6NFQ2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCAF2A6NFQ2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCAF2A6NFQ2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCAF2A6NFQ2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCAF2A6NFQ2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCAF2A6NFQ2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCAF2A6NFQ2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCAF2A6NFQ2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCAF2A6NFQ2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCAF2A6NFQ2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCAF2A6NFQ2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCAF2A6NFQ2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCAF2A6NFQ2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCAF2A6NFQ2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCAF2A6NFQ2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCAF2A6NFQ2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCAF2A6NFQ2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCAF2A6NFQ2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCAF2A6NFQ2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCAF2A6NFQ2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCAF2A6NFQ2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCAF2A6NFQ2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCAF2A6NFQ2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCAF2A6NFQ2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCAF2A6NFQ2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCAF2A6NFQ2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCAF2A6NFQ2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCAF2A6NFQ2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCAF2A6NFQ2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCAF2A6NFQ2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCAF2A6NFQ2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCAF2A6NFQ2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCAF2A6NFQ2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCAF2A6NFQ2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCAF2A6NFQ2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCAF2A6NFQ2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCAF2A6NFQ2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCAF2A6NFQ2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCAF2A6NFQ2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TCAF2A6NFQ2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TCAF2A6NFQ2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TCAF2A6NFQ2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCAF2A6NFQ2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TCAF2A6NFQ2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCAF2A6NFQ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCAF2A6NFQ2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCAF2A6NFQ2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCAF2A6NFQ2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCAF2A6NFQ2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCAF2A6NFQ2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCAF2A6NFQ2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCAF2A6NFQ2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCAF2A6NFQ2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms