Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRIT2A6NDA9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRIT2A6NDA9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRIT2A6NDA9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRIT2A6NDA9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRIT2A6NDA9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRIT2A6NDA9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRIT2A6NDA9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIT2A6NDA9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRIT2A6NDA9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRIT2A6NDA9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRIT2A6NDA9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRIT2A6NDA9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRIT2A6NDA9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRIT2A6NDA9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRIT2A6NDA9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRIT2A6NDA9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRIT2A6NDA9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRIT2A6NDA9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRIT2A6NDA9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRIT2A6NDA9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRIT2A6NDA9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIT2A6NDA9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIT2A6NDA9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIT2A6NDA9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIT2A6NDA9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIT2A6NDA9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRIT2A6NDA9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRIT2A6NDA9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRIT2A6NDA9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIT2A6NDA9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIT2A6NDA9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIT2A6NDA9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIT2A6NDA9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIT2A6NDA9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIT2A6NDA9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRIT2A6NDA9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRIT2A6NDA9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRIT2A6NDA9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRIT2A6NDA9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRIT2A6NDA9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIT2A6NDA9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIT2A6NDA9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIT2A6NDA9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIT2A6NDA9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIT2A6NDA9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIT2A6NDA9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRIT2A6NDA9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRIT2A6NDA9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRIT2A6NDA9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRIT2A6NDA9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIT2A6NDA9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIT2A6NDA9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIT2A6NDA9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIT2A6NDA9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIT2A6NDA9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIT2A6NDA9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIT2A6NDA9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIT2A6NDA9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIT2A6NDA9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIT2A6NDA9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIT2A6NDA9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIT2A6NDA9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIT2A6NDA9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIT2A6NDA9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIT2A6NDA9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIT2A6NDA9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIT2A6NDA9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIT2A6NDA9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIT2A6NDA9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIT2A6NDA9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRIT2A6NDA9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRIT2A6NDA9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRIT2A6NDA9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRIT2A6NDA9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRIT2A6NDA9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIT2A6NDA9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIT2A6NDA9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRIT2A6NDA9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms