Protein–RNA interactions for Protein: A1A4F0

PQLC2L, Putative uncharacterized protein PQLC2L, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC2LA1A4F0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PQLC2LA1A4F0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PQLC2LA1A4F0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PQLC2LA1A4F0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PQLC2LA1A4F0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PQLC2LA1A4F0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PQLC2LA1A4F0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PQLC2LA1A4F0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PQLC2LA1A4F0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PQLC2LA1A4F0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PQLC2LA1A4F0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PQLC2LA1A4F0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PQLC2LA1A4F0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PQLC2LA1A4F0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PQLC2LA1A4F0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PQLC2LA1A4F0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PQLC2LA1A4F0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PQLC2LA1A4F0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PQLC2LA1A4F0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PQLC2LA1A4F0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PQLC2LA1A4F0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PQLC2LA1A4F0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PQLC2LA1A4F0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PQLC2LA1A4F0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PQLC2LA1A4F0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PQLC2LA1A4F0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PQLC2LA1A4F0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PQLC2LA1A4F0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PQLC2LA1A4F0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PQLC2LA1A4F0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PQLC2LA1A4F0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PQLC2LA1A4F0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PQLC2LA1A4F0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PQLC2LA1A4F0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PQLC2LA1A4F0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PQLC2LA1A4F0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PQLC2LA1A4F0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PQLC2LA1A4F0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PQLC2LA1A4F0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PQLC2LA1A4F0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PQLC2LA1A4F0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PQLC2LA1A4F0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PQLC2LA1A4F0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PQLC2LA1A4F0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PQLC2LA1A4F0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PQLC2LA1A4F0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PQLC2LA1A4F0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PQLC2LA1A4F0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PQLC2LA1A4F0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PQLC2LA1A4F0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 618.5 ms