Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVZ2

FAM240B, Protein FAM240B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM240BA0A1B0GVZ2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM240BA0A1B0GVZ2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM240BA0A1B0GVZ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM240BA0A1B0GVZ2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM240BA0A1B0GVZ2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM240BA0A1B0GVZ2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM240BA0A1B0GVZ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM240BA0A1B0GVZ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM240BA0A1B0GVZ2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM240BA0A1B0GVZ2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM240BA0A1B0GVZ2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM240BA0A1B0GVZ2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM240BA0A1B0GVZ2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM240BA0A1B0GVZ2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM240BA0A1B0GVZ2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM240BA0A1B0GVZ2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM240BA0A1B0GVZ2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM240BA0A1B0GVZ2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM240BA0A1B0GVZ2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM240BA0A1B0GVZ2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM240BA0A1B0GVZ2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM240BA0A1B0GVZ2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM240BA0A1B0GVZ2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM240BA0A1B0GVZ2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM240BA0A1B0GVZ2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM240BA0A1B0GVZ2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM240BA0A1B0GVZ2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM240BA0A1B0GVZ2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM240BA0A1B0GVZ2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM240BA0A1B0GVZ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM240BA0A1B0GVZ2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM240BA0A1B0GVZ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM240BA0A1B0GVZ2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM240BA0A1B0GVZ2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM240BA0A1B0GVZ2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM240BA0A1B0GVZ2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM240BA0A1B0GVZ2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM240BA0A1B0GVZ2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM240BA0A1B0GVZ2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM240BA0A1B0GVZ2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM240BA0A1B0GVZ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM240BA0A1B0GVZ2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM240BA0A1B0GVZ2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM240BA0A1B0GVZ2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM240BA0A1B0GVZ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM240BA0A1B0GVZ2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM240BA0A1B0GVZ2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM240BA0A1B0GVZ2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM240BA0A1B0GVZ2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM240BA0A1B0GVZ2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM240BA0A1B0GVZ2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM240BA0A1B0GVZ2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM240BA0A1B0GVZ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM240BA0A1B0GVZ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM240BA0A1B0GVZ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM240BA0A1B0GVZ2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM240BA0A1B0GVZ2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM240BA0A1B0GVZ2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM240BA0A1B0GVZ2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM240BA0A1B0GVZ2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM240BA0A1B0GVZ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM240BA0A1B0GVZ2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM240BA0A1B0GVZ2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM240BA0A1B0GVZ2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM240BA0A1B0GVZ2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM240BA0A1B0GVZ2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM240BA0A1B0GVZ2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM240BA0A1B0GVZ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM240BA0A1B0GVZ2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM240BA0A1B0GVZ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM240BA0A1B0GVZ2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM240BA0A1B0GVZ2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM240BA0A1B0GVZ2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM240BA0A1B0GVZ2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM240BA0A1B0GVZ2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM240BA0A1B0GVZ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM240BA0A1B0GVZ2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM240BA0A1B0GVZ2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM240BA0A1B0GVZ2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms