Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN6Q9Y6Q1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN6Q9Y6Q1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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