Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LAMC3Q9Y6N6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.46
LAMC3Q9Y6N6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms