Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A2

CYP46A1, Cholesterol 24-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP46A1Q9Y6A2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP46A1Q9Y6A2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP46A1Q9Y6A2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms