Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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SNX13Q9Y5W8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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SNX13Q9Y5W8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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SNX13Q9Y5W8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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SNX13Q9Y5W8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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SNX13Q9Y5W8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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SNX13Q9Y5W8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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SNX13Q9Y5W8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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SNX13Q9Y5W8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SNX13Q9Y5W8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SNX13Q9Y5W8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX13Q9Y5W8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
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