Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B9

SUPT16H, FACT complex subunit SPT16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT16HQ9Y5B9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUPT16HQ9Y5B9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUPT16HQ9Y5B9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms