Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG6Q9Y2V7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms