Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM50BQ9Y247 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM50BQ9Y247 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM50BQ9Y247 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM50BQ9Y247 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM50BQ9Y247 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM50BQ9Y247 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM50BQ9Y247 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM50BQ9Y247 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM50BQ9Y247 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM50BQ9Y247 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM50BQ9Y247 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM50BQ9Y247 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM50BQ9Y247 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms