Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACSIN2Q9UNF0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN2Q9UNF0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms