Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF490Q9ULM2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms