Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2AQ9ULE3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms