Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY1

HSPB8, Heat shock protein beta-8, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB8Q9UJY1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB8Q9UJY1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms