Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNAL1Q9UBT7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms