Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCL2Q9UBD3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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