Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC10Q9NYD6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms