Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL11Q9NVR0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL11Q9NVR0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms