Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CISHQ9NSE2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CISHQ9NSE2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms