Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A8Q9C0K1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A8Q9C0K1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms