Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CHCHD7Q9BUK0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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CHCHD7Q9BUK0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHCHD7Q9BUK0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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