Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFAF3Q9BU61 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms