Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms