Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms