Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL2Q9BQD1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms