Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED1Q99966 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms