Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPA33Q99795 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPA33Q99795 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms