Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCF12Q99081 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms