Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RILPQ96NA2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RILPQ96NA2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms