Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAMP1Q96JM3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms