Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COG3Q96JB2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms