Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BORCS6Q96GS4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BORCS6Q96GS4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms