Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms