Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms