Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms