Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms