Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSIP1Q8NA03 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms