Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR7Q8N806 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms