Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVF7

FMNL3, Formin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMNL3Q8IVF7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FMNL3Q8IVF7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FMNL3Q8IVF7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms