Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SKAP1Q86WV1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKAP1Q86WV1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms