Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LINC00523Q86TU6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00523Q86TU6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00523Q86TU6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00523Q86TU6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00523Q86TU6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms