Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms