Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms