Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGALS9CQ6DKI2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGALS9CQ6DKI2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGALS9CQ6DKI2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGALS9CQ6DKI2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LGALS9CQ6DKI2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LGALS9CQ6DKI2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LGALS9CQ6DKI2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LGALS9CQ6DKI2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LGALS9CQ6DKI2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LGALS9CQ6DKI2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LGALS9CQ6DKI2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms