Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUPD1Q68J44 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms