Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK2Q5EBM0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms