Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms